فضل بن یونس از حضرت ابى الحسن (موسى بن جعفر علیه السلام ) حدیث کند که آن حضرت به من فرمود این دعا را بسیار بخوان :
اللهم لا تجعلنى من المعارین و لا تخرجنى من التقصیر.
(یعنى بار خدایا مرا از عاریت داده شدگان (ایمان ) قرار مده و از تقصیر بیرون مبر) گوید: من عرض کردم : اما عاریت داده شدگان ، معنایش را دانستم ، ولى معناى مرا از تقصیر بیرون مبر چیست ؟ فرمود: هر کارى را که به خاطر خداى عزو جل انجام دهى پس خود را در آن کار پیش خود مقصر بدان ، زیرا که همه مردم در کارهایشان میان خود و خداى عز و جل تقصیر کار و مقصرند)). ⁽¹³⁸⁾
ادعیه حضرت امام رضا علیه السلام 
دعاى آن حضرت در تسبیح و تنزیه خداوند در روز دهم و یازدهم ماه
سبحان خالق النور، سبحان خالق الظلمة ، سبحان خالق المیاه سبحان خالق السماوات ، سبحان خالق الارضین ، سبحان خالق الریاح و النبات ، سبحان خالق الحیاة و الموت ، سبحان خالق الثرى و الفلوات ، سبحان الله و بحمده . ⁽¹³⁹⁾
دعاى آن حضرت در قنوت نماز وتر 
هفتاد مرتبه : ((استغفرالله و اساله التوبة )). ⁽¹⁴⁰⁾
ایضا دعاى آن حضرت در قنوت
رب اغفر و ارحم ، و تجاوز عما تعلم ، انک انت الاعز الاجل الاکرم . ⁽¹⁴¹⁾
دعاى آن حضرت در تعقیب نماز صبح و اسم اعظم الهى 
از حضرت امام رضا علیه السلام روایت شده که فرمود: هر که بعد از صبح صد بار بگوید:
بسم الله الرحمن الرحیم ، لا حول و لا قوة الا بالله العلى العظیم .
این سخن از سیاهى چشم به سپیدى آن نزدیکتر به اسم الهى است . ⁽¹⁴²⁾
دعاى آن حضرت در نماز استسقاء  
روایت شده پس از آن که مامون آن حضرت را به ولایتعهدى منصوب کرد مدتى باران نبارید، بعضى از اطرافیان مامون و دشمنان آن حضرت مى گفتند: بنگرید آن گاه که على بن موسى نزد ما آمد و ولایتعهد شد باران قطع گردید: تا آن جا که گوید: در روز دوشنبه براى طلب باران آن حضرت به صحرا آمد و مردم مى نگریستند، ایشان بالاى منبر رفت ، پس از حمد و ثناى الهى فرمود:
اللهم یا رب انت عظمت حقنا اهل البیت ، فتوسلوا بنا کما امرت ، و اسلوا فضلک و رحمتک و توقعوا احسانک و نعمتک فاسقهم سقیا نافعا عاما غیر رائث و لا ضائر، و لیکن ابتداء مطرهم بعد انصرافهم من مشهدهم هذا الى منازلهم و مقارهم . ⁽¹⁴³⁾
دعاى آن حضرت در رفع غم و اندوه 
اللهم انت ثقتى فى کل کرب ، و انت رجائى فى کل شدة ، و انت لى فى کل امر نزل بى ثقة و عدة ، کم من کرب یضعف عنه الفواد، و تقل فیه الحیلة ، و تعیى فیه الامور، و یخذل فیه البعید و القریب و الصدیق ، و یشمت فیه العدو انزلته بک و شکوته الیک ، راغبا الیک فیه عمن سواک ، ففرجته و کشفته و کفیتنیه ، فانت ولى کل نعمة ، و صاحب کل حاجة ، و منتهى کل رغبة ، فلک الحمد کثیرا، و لک المن فاضلا، بنعمتک تتم الصالحات ، یا معروفا بالمعروف معروف ، و یا من هو بالمعروف موصوف ، انلنى من معروفک معروفا تغنینى به عن معروف من سواک ، برحمتک یا ارحم الراحمین . ⁽¹⁴⁴⁾
دعاى آن حضرت براى دفع بلا 
لا حول و لا قوة الا بالله العلى العظیم . ⁽¹⁴⁵⁾
دعاى آن حضرت براى قضاء حوائج 
از مقاتل بن مقاتل روایت شده : به آن حضرت عرضه داشت : فدایت شوم دعائى براى قضاء حوائج به من تعلیم فرما، فرمود: هرگاه حاجت مهمى بسوى خداوند داشتى غسل کرده و بهترین لباست را بپوش و مقدارى بوى خوش استعمال کرده و زیر آسمان برو، و دو رکعت نماز گذار، نماز را آغاز کرده و سوره حمد را مى خوانى و سپس پانزده مرتبه سوره توحید را قرائت مى کنى ، آن گاه به رکوع رفته و پانزده مرتبه این سوره را مى خوانى ، و مانند نماز جعفر طیار ادامه مى دهى ، غیر از آن که در این نماز قرائت پانزده مرتبه مى باشد، بعد از نماز به سجده رفته و مى گوئى :
اللهم ان کل معبود من لدن عرشک الى قرار ارضک فهو باطل سواک ، فانک انت الله الحق المبین ، اقض لى حاجة کذا و کذا (حاجت را یاد کنید) الساعة الساعة و در این مورد اصرار مى کنى . ⁽¹⁴⁶⁾
دعاى آن حضرت براى قضاء حوائج با توسل به قرآن
از حضرت امام رضا علیه السلام روایت شده : هرگاه امر شدیدى بر تو عارض شد دو رکعت نماز بگذار، در یکى از آن ها سوره حمد و آیة الکرسى ، و در رکعت دوم سوره حمد و قدر را بخوان ، پس ، پس قرآن را بالاى سر خود قرار داده و بگو: اللهم بحق من ارسلته الى خلقک ، و بحق کل ایة فیه ، و بحق کل من مدحته فیه علیک ، و بحقک علیه ، و لا نعرف احدا اعرف بحقک منک ، یا سیدى یا الله (ده بار) بحق محمد (ده بار) بحق على (ده بار) بحق فاطمة (ده بار). و نام هر یک از امامان بعد از او را برده و به حق آنان خداوند را ده بار سوگند بده ، تا این که به امام زمان خودت برسى ، از جایگاهت بر نمى خیزى مگر این که حاجتت برآورده شده باشد. ⁽¹⁴⁷⁾
ایضا از براى قضاء حوائج از آن حضرت روایت شده : دو رکعت نماز خوانده ، در هر رکعت یک بار سوره حمد و سیزده بار سوره قدر خوانده شود، پس از فراغ به سجده رفته و گوید:
اللهم یا فارج الهم ، و کاشف الغم ، و مجیب دعوة المضطرین یا رحمان الدنیا و رحیم الاخرة ، صل على محمد و آل محمد، و ارحمنى رحمة تطفى ء بها عنى غضبک و سخطک و تغنینى بها عن رحمة من سواک
سپس گونه راستش را بر زمین قرار داده و گوید:
یا مذل کل جبار عنید، و یا معز کل ذلیل ، و حقک قد بلغ المجهود منى فى امر کذا، ففرج عنى .
سپس گونه چپش را روى زمین نهاده و همین سخن را مى گوید آن گاه به سجده رفته و این ذکر را تکرار مى نماید، خداوند غم او را برطرف و حاجتش را برمى آورد. ⁽¹⁴⁸⁾
دعاى آن حضرت براى اداء دین 
از امام جواد علیه السلام روایت شده : شخصى نزد امام رضا علیه السلام آمده و گفت : اى فرزند رسول خدا، فرزندان بسیار داشته و دینى بر گردن دارم و دچار مشکل شده ام ، دعائى به من بیاموز که هرگاه خدا را بدان دعا بخوانم خداوند روزى به من عنایت فرماید، فرمود: اى بنده خدا وضو بگیر و آن را زیبا به عمل آور، سپس دو رکعت نماز به جا آور، که رکوع و سجده آن را کامل انجام دهى ، سپس بگو:
یا ماجد یا کریم ، یا واحد یا کریم ، اتوجه الیک بمحمد نبیک نبى الرحمة : یا محمد یا رسول الله ، انى اتوجه بک الى الله ربک و رب کل شى ء ان تصلى على محمد و على اهل بیته . و اسالک نفحة من نفحاتک ، و فتحا یسیرا، و رزقا واسعا، الم به شعتى و اقضى به دینى ، و استعین به على عیالى .⁽¹⁴⁹⁾
دعاى آن حضرت در پوشیده ماندن از دشمنان 
استسلمت مولاى لک ، و اسلمت نفسى الیک ، و توکلت فى کل امورى علیک و انا عبدک و ابن عبدیک ، اخبانى اللهم فى سترک عن شرار خلقک و اعصمنى من کل اذى و سوء بمنک ، و اکفنى شر کل ذى شر بقدرتک .
اللهم من کادنى او ارادنى فانى ادرابک فى نحره ، و استعین بک منه ، و استعیذ منه بحولک و قوتک ، و شد عنى ایدى الظالمین اذ کنت ناصرى لا اله الا انت ، یا ارحم الراحمین ، و اله العالمین . اسالک کفایة الاذى ، و العافیة و الشفاء، و النصر على الاعداء، و التوفیق لما تحب ربنا و ترضى ، یا اله العالمین ، یا جبار السماوات و الارضین ، یا رب محمد و اله الطیبین الطاهرین صلواتک علیهم اجمعین . ⁽¹⁵⁰⁾
دعاى آن حضرت دررفع شر دشمنان 
روایت شده : هنگامى که امام رضا علیه السلام بشهادت رسیدند در لباس آن حضرت این تعویذ پیدا شد،در آخر آن چنین نوشته شده بود که از پدرانش ‍ روایت شده که جدشان على علیه السلام این تعویذ را براى دفع شر دشمنان به کار برده و در غلاف شمشیرش قرار داشت ، و در آخر آن نامهاى الهى است ، و آن حضرت بر فرزندان و خاندانش شرط کرده که آن را بر علیه کسى نخوانند، چرا که هر که این دعا را بخواند دعایش محجوب نمى ماند:
اللهم بک استفتح ، و بک استنجح ، و بمحمد صلى الله علیه و آله اتوجه ، اللهم سهل لى حزونته و کل حزونة ، و ذلل لى صعوبته و کل صعوبة ، و اکفنى موونته و کل موونة .
و ارزقنى معروفه و وده ، و اصرف عنى ضره و معرته ، انک تمحو ما تشاء و تثبت و عندک ام الکتاب ، الا ان اولیاء الله لا خوف علیهم و لا هم یحزنون .
انا رسل ربک لن یصلوا الیک طه حم لا یبصرون ، و جعلنا فى اعناقهم اغلاقا فهى الى الاذقان فهم مقمحون ، و جعلنا من بین ایدیهم سدا، و من خلفهم سدا فاغشینا هم فهم لایبصرون .
اولئک الذین طبع الله على قلوبهم و سمعهم و ابصارهم و اولئک هم الغافلون لا جرم ان الله یعلم ما یسرون و ما یعلنون فسیکفیکهم الله و هو السمیع العلیم ، و تریهم ینظرون الیک و هم لا یبصرون . صم بکم عمى فهم لا یرجعون ، طسم تلک آیات الکتاب المبین ، لعلک باخع نفسک الا یکونوا مومنین ، ان نشا ننزل علیهم من السماء ایة ، فظلت اعناقهم لها خاضعین .
نامها: اللهم انى اسالک بالعین التى لا تنام ، و بالعز الذى لا یرام ، و بالملک الذى لا یضام ، و بالنور الذى لا یطفى ، و بالوجه الذى لا یبلى ، و بالحیاة الذى لا تموت ، و بالصمدیة التى لا تقهر، و بالدیمومیة التى لا تقنى ، و بالاسم الذى لا یرد، و بالربوبیة التى لا تستذل ، ان تصلى على محمد و ال محمد، و ان تفعل بى کذا و کذا.
و حاجتت را ذکر مى کنى انشاء الله انجام مى شود ⁽¹⁵¹⁾
تعویذى ⁽¹⁵²⁾ دفع دشمن و بلا و حفظ از شیطان 
از یاسر خادم روایت شده : هنگامى که امام رضا علیه السلام به قصر حمید بن قحطبه رفت لباس خود را در آورد، و به حمید داد، تا آن جا که گوید، گفتم : فدایت شوم کنیز کاغذى را در لباس شما یافته آن چیست ؟ فرمود: اى حمید این تعویذى است که از آن جدا نمى شویم ، گفتم : اگر مرا بدان مفتخر گردانى ، فرمود: این تعویذى است که هر که آن را در لباسش نگاه دارد، بلا از آن دور بوده ، و در مقابل شیطان رانده شده او را نگاه مى دارد:
بسم الله الرحمن الرحیم ، بسم الله انى اعوذ بالرحمان منک ان کنت تقیا او غیر تقى ، اخذت بالله السمیع البصیر على سمعک و بصرک ، لا سلطان لک على ، و لا على سمعى ، و لا على بصرى ، و لا على شعرى ، و لا على بشرى ، و لا على لحمى ، و لا على دمى ، و لا على مخى ، و لا على عصبى ، و لا على عظامى ، و لا على مالى ، و لا على ما رزقنى ربى .
سترت بینى و بینک بستر النبوة الذى استتر انبیاء الله به ، من سطوات الجبابرة و الفراعنة ، جبرئیل عن یمینى ، و میکائیل عن یسارى ، و اسرافیل عن ورائى ، و محمد صلى الله علیه وآله امامى ، و الله مطلع على ، یمنعک منى و یمنع الشیطان منى ، اللهم لا یغلب جهله اناتک ان یستفزنى و یستخفنى ، اللهم الیک التجات ، اللهم الیک التجات ، اللهم الیک التجات . ⁽¹⁵³⁾
دعاى آن حضرت در رفع دشمن  
از امام رضا علیه السلام روایت شده : هرگاه یکى از شما خواست بر علیه دشمنش دعا کند، بگوید:
اللهم اطرقه بلیلة لااخت لها، و ابح حریمه . ⁽¹⁵⁴⁾
دعاى آن حضرت در تعویذ هر درد 
خالد عبسى گوید: آن حضرت این تعویذ را به من آموخت و فرمود: این را به برادران مومنت آموزش بده که براى هر دردى است :
اعیذ نفسى برب الارض و رب السماء، اعیذ نفسى بالذى اسمه برکة و شفاء. ⁽¹⁵⁵⁾
دعاى آن حضرت براى تمامى بیماریها 
زکریا بن آدم مقرى که خادم آن حضرت مى باشد گوید: روزى امام علیه السلام مرا صدا زد و فرمود: بر تمامى بیماریها بگو:
یا منزل الشفاء، و مذهب الداء، انزل على وجعى الشفاء. ⁽¹⁵⁶⁾
دعاى آن حضرت براى درد تب  
کفعمى گوید: به خط آن حضرت یافت شد که براى تب روى سه ورق کاغذ نوشته مى شود:
در برگه اول نوشته مى شود: بنام خداوند بخشنده مهربان ، نترس تو برتر میباشى . و در برگه دوم بعد از: بنام خداوند بخشنده مهربان : نترس ، از گروه ستمکاران نجات یافتى . و دربرگه سوم بعد از: بنام خداوند بخشنده مهربان : آگاه باش عالم امرو خلق از آن اوست ، مبارک است خداوند که پروردگار جهانیان است .
آن گاه بر هر قطعه سه بار سوره توحید خوانده و شخص تب دار هر برگه را در یک روز مى بلعد، تا درسه روز انجام شود، که بیارى خدا شفا مى یابد. ⁽¹⁵⁷⁾
دعاى آن حضرت براى بیمارى ثالول ⁽¹⁵⁸⁾
على بن نعمان گوید: به امام علیه السلام عرض کردم : فدایت شوم لکه هاى قرمز (زگیل ) بسیارى در بدنم قرار دارد و مرا ناراحت نموده است ، از تو مى خواهم که مرا چیزى بیاموزى که بهره ام دهد، امام فرمود:
براى هر ثولول هفت جو بگیر و برر هفت جو هفت بار (اذا وقعت الواقعة ) تا (فکانت هباء منبثا)⁽¹⁵⁹⁾ بخوان ، سپس این آیه را بخوان . و یسئلونک عن الجبال فقل ینسفها ربى نسفا، فیذرها قاعا صفصفا، لاترى فیها عوجا و لا امتا.⁽¹⁶⁰⁾
سپس جوها را یکى یکى بگیر و هر ثولولى را باآن مسح کن ، پس آن را در پارچه جدیدى نهاده و سنگى در آن قرار ده و در چاه فاضلابى بینداز. ⁽¹⁶¹⁾
ایضا دعاى دیگر آن حضرت براى بیمارى ثالول 
از آن حضرت نقل است : به اولین ستاره اى که در شب ظاهر مى شود نظر افکن ولى نظرت تیز نباشد، مقدارى خاک بردار و به خود بمال در حالى که مى گویى : بسم الله و بالله ، رایتنى و لم ارک سوء عود بصرک الله یخفى اثرک ، ارفع ثالیلى معک . ⁽¹⁶²⁾
دعاى آن حضرت براى بیمارى خنازیر⁽¹⁶³⁾ 
یا رووف یا رحیم ، یا رب یا سیدى ⁽¹⁶⁴⁾
حضرت رضا علیه السلام فرمود: دخترکى از ما (یا کنیزکى ) در گردنش ‍ خنازیرى بیرون آمد، پس کسى نزد من آمد و گفت : اى على (بن موسى الرضا) باو بگو: این دعا را بخواند: یا رووف یا رحیم یا رب یا سیدى و آن را تکرار کند، فرمود: پس این کلمات را گفت و خداى عز و جل آن خنازیر را از او برطرف کرد (راوى ) گوید: فرمود: و این دعا همان است که جعفر بن سلیمان با آن دعا کرد.